Dashboard Unison COVID-19 Sonora
Este tablero es un recurso elaborado por un grupo de profesores del Departamento de Matemáticas de la Universidad de Sonora del área de Ciencia de Datos. El tablero se realizó en el lenguje R usando el lenguaje de marcado Rmarkdown y la plantilla flexdashboard for R. Nos basamos en un ejemplo base desarrollado por Rami Krispin y el cual se puede consultar aquí.
Datos
Los datos sobre el proceso del COVID-19 en el Estado de Sonora se reciben diariamente de la Secretaría de Salud del Estado de Sonora (SSA Sonora). Particularmente la información sobre camas ocupadas proviene del Informe Hospitalario Diario COVID19 de la SSA Sonora. Los datos sobre el proceso del COVID-19 de los estados de México se tomaron del repositorio de datos mantenido por Gabriel Alfonso Carranco-Sapiéns. Esta base se actualiza cada día a partir de la información de la SSA. Los datos sobre la población de México se tomaron de INEGI. Los datos sobre el proceso del COVID-19 en el estado Arizona (EU) se tomaron del Centro de recursos sobre Coronavirus de la Universidad Johns Hopkins University & Medicine. Esta base de datos se actualiza cada día y se puede obtener aquí.
Definición de variables y términos
Confirmados: cantidad de pruebas que resultaron positivas a SARS-CoV2
Recuperados: cantidad de pacientes confirmados dados de alta
Decesos: cantidad de pacientes fallecidos en casos confirmados
Mediana de edad: mediana estadística del rango de edades de casos confirmados
Pruebas realizadas: cantidad de casos confirmados más cantidad de pruebas negativas
Pruebas negativas: cantidad pruebas que dieron negativo a SARS-CoV-2
Pruebas en proceso: cantidad pruebas que se encuentran en proceso a la espectativa del resultado.
Incidencia: Confirmados por cada 100 mil habitantes.
Activos: Pacientes que tienen una segunda muestra positiva o comenzaron síntomas hace 14 días o menos y pacientes hospitalizados
Seguimiento terminado: Pacientes que han pasado más de 14 días desde el inicio de síntomas con un cuadro leve con manejo en casa.
Indicadores
Los indicadores son calculados a partir de las siguientes fórmulas:
\(Tasa\ de\ Letalidad = \frac{\mbox{Decesos}}{\mbox{Confirmados}} 100\)
\(Tasa\ de\ Positividad = \frac{\mbox{Confirmados}}{\mbox{Pruebas realizadas}} 100\)
\(Positividad\ Lesp = \frac{\mbox{Pruebas positivas del día}}{\mbox{Pruebas analizadas LESP del día}} 100\)
LESP: Laboratorio Estatal de Salud Pública
Las cantidades corresponden a las mediciones hechas a partir del día 2 de marzo de 2020 al último día indicado en la curva de evolución de casos confirmados de Sonora.
Paquetes utilizados y documentación
Reproducibilidad
El tablero se genera diariamente como una página web estática. Es posible realizar un fork al proyecto en Github, descargarlo, modificarlo y publicar un tablero similar en las páginas web que desees.
Contacto O. Gutú | J. P. Soto | J. Waissman | C. Minjárez
Licencia MIT
Copyright (c) 2020 Universidad de Sonora
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